Colossal Biosciences розробляє ШІ для прискорення воскресіння вимерлих видів
Компанія Colossal Biosciences оголосила про запуск нової платформи на базі штучного інтелекту, яка має прискорити роботу над воскресінням вимерлих видів. Про це ексклюзивно повідомляє TechCrunch.
Платформа під назвою GenoMorph використовує передові методи 3D-морфології, порівняльної геноміки та еволюційної біології для виявлення генів, які можна редагувати в проєктах з де-екстинкції, навіть за обмежених генетичних даних. Компанія вже застосовує її у спробі відтворити додо, для якого доступно небагато геномів.
Наприклад, для проєкту з відродження додо компанія працює лише з одним геномом, тоді як для проєкту з відродження шерстистого мамонта їм вдалося зібрати близько 100 геномів. За словами представників компанії, ДНК шерстистого мамонта збереглася краще, оскільки тварина мешкала в холодних регіонах, тоді як додо — в тропіках.
«Зазвичай вчені можуть порівнювати багато геномів, щоб зрозуміти, які генетичні відмінності відповідають за певні ознаки, — розповів TechCrunch генеральний директор і співзасновник Colossal Бен Лемм. — Ми не маємо такої розкоші з давньою ДНК вимерлих видів, адже повних геномів нам вдається отримати лише невелику кількість».
Для створення GenoMorph, за словами Лемма, компанія зібрала великий обсяг даних про розвиток птахів, таких як «курки, перепілки, качки та голуби», а також об’єднала їх із «генетичною інформацією та 3D-вимірами черепів понад 70 видів птахів». Розробка цієї платформи, яка базується на багаторічному досвіді компанії в де-екстинкції, зайняла понад рік.
«Штучний інтелект вивчає, які ділянки ДНК активні під час розвитку дзьобів та лицьових структур у різних птахів, і використовує цю інформацію для прогнозування, які генетичні “перемикачі” могли надати додо його знаковий вигляд», — пояснив Лемм. Він запропонував уявити платформу як «карту скарбів геному додо», яка, замість пошуку серед безлічі потенційних генетичних відмінностей, допомагає команді Colossal знаходити лише ті, що мають значення.
«Наразі ми визначили приблизно 2300 перспективних цілей для редагування ДНК, що стосуються лицьової морфології черепа додо, які тепер можемо протестувати в лабораторії», — додав він. Лемм зазначив, що GenoMorph допоможе компанії подолати одну з найбільших перешкод на шляху до відродження вимерлих видів — визначення того, які зміни роблять вид унікальним. Проте, за його словами, вченим також потрібно перевірити, чи можуть ці редагування призвести до бажаних фізичних ознак.
«Ми розробили нову систему, яка використовує ліпідні наночастинки для доставки інструментів для редагування генів безпосередньо в ембріони птахів, що розвиваються», — сказав він. Це дозволить команді спостерігати, як певні генетичні зміни впливають на розвиток пташеня «без необхідності чекати повного репродуктивного циклу, який вимагає досягнення птахами статевої зрілості».
Компанія також повідомила, що її колонія нікобарських голубів налічує 36 птахів, і їм вдалося створити стовбурові клітини, з яких розвиваються яйцеклітини та сперматозоїди.
«Оскільки нікобарський голуб є найближчим живим родичем додо, ці клітини є критично важливими для нашої стратегії зі створення птахів, які нестимуть риси додо», — зазначив Лемм. Наступним кроком компанія планує підтвердити прогнози GenoMorph у лабораторних умовах. «Найцікавіше те, що ми наближаємося до точки, коли різні технології, які ми розробляли, починають збігатися і допомагати іншим проєктам, над якими ми працюємо в абсолютно інших частинах еволюційного дерева», — додав він.
Відповідаючи на запитання про безпеку редагування генів таким чином, Лемм підкреслив, що мета розробки GenoMorph — зробити генну інженерію «більш точною, контрольованою та тестованою». Він пояснив, що продукт сам по собі не редагує гени, а допомагає команді виявити, які генетичні зміни варті дослідження.
«Виявлення потенційного редагування не означає, що ми негайно вводимо його тварині або вважаємо безпечним, — продовжив він. — Чим точніше ми зможемо виявляти та перевіряти ці зміни, тим більш обґрунтованими будуть наші рішення протягом усього процесу».
Тим часом, новітня технологія Colossal Biosciences вже отримала підтримку засновника XPRIZE Пітера Діамандіса. Діамандіс, який є інвестором Colossal, оголосив про заснування нової венчурної компанії NeoGenesis Capital для підтримки компаній, що використовують платформу програмованої біології Colossal Biosciences у сферах охорони здоров’я, сільського господарства та збереження природи.
Джерело новини: techcrunch.com